A história acompanha Gabimaru, um ninja extremamente forte que foi desertado de sua vila após agir contra os costumes locais. Por mais diga não ter motivos para estar vivo, Gabimaru sobreviveu a várias tentativas de execução, incluindo decapitações.

Por conta disso, um de seus carrascos diz que ele tem um forte apego a vida, e o designa para uma última missão: encontrar o elixir da imortalidade.